128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1001 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  96.98 
 
 
298 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  97.99 
 
 
298 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  82.07 
 
 
292 aa  481  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  65.07 
 
 
294 aa  390  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
381 aa  208  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 
295 aa  201  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  37.59 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  37.05 
 
 
301 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  38.49 
 
 
302 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
301 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  36.99 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  35.42 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
302 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  36.93 
 
 
301 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  35.97 
 
 
303 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  35.89 
 
 
286 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  34.98 
 
 
288 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  37.5 
 
 
320 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  34.38 
 
 
422 aa  163  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  32.17 
 
 
316 aa  159  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  32.87 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 
526 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  32.89 
 
 
405 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  32.3 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  30.74 
 
 
299 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  30.27 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  30.69 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  29.23 
 
 
302 aa  125  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  28.08 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  28.42 
 
 
285 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  25.42 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  23.92 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  25.72 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.93 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  26.92 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  26.94 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  28.77 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  26.91 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  27.59 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  26.94 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  25.22 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  24.68 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  25.27 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  28.65 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  25.89 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  31.01 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  23.89 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  26.59 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  28.51 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  39.24 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  25 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  23.66 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  37.97 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  28.87 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  37.97 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  37.97 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  37.97 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  32 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  25.34 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  22.76 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  25.55 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  29.15 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  31.82 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  35.44 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  35.44 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  35.44 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  31.2 
 
 
285 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  24.64 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  24.39 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  24.88 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  24.88 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  23.9 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  29.92 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  23.35 
 
 
558 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  23.53 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  35.44 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  25.11 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  24.39 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  24.64 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  24.69 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  23.9 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  23.9 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  24.88 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  24.88 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  23.41 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  41.67 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  24.39 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  24.34 
 
 
282 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  25.11 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>