124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0548 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  50.67 
 
 
381 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 
295 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  47.99 
 
 
301 aa  247  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  45.19 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  43.11 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  44.44 
 
 
285 aa  241  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  44.09 
 
 
303 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  43.71 
 
 
304 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  39.78 
 
 
285 aa  221  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  39.64 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  38.01 
 
 
286 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  43.59 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  37.14 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  38.76 
 
 
320 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  35.34 
 
 
298 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  34.78 
 
 
422 aa  165  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  35.56 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  34.98 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  33.45 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  34.28 
 
 
292 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  37.36 
 
 
526 aa  160  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  33.45 
 
 
299 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  33.94 
 
 
316 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  34.7 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  34.69 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  36.06 
 
 
306 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  32.74 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  29.66 
 
 
285 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  28.78 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  31.02 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  30.4 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  31.31 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  31.03 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  29.52 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  30.08 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  33.05 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
261 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  30.97 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  27.71 
 
 
254 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  27.27 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  28.3 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  24.79 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  26.07 
 
 
495 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  29.29 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  29 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  30 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  26.95 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  27.91 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  28.44 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  30.67 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  28.11 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  26.27 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  31.74 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  27.57 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  28.17 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  26.18 
 
 
626 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  26.24 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  26.15 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  28.08 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  25.34 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  25.34 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  26.82 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  25.57 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  26.82 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  26.82 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  30.41 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  27.7 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  26.82 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  27.78 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  26.17 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  26.15 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  27.6 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  28.97 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  26.32 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  28.3 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  27.65 
 
 
297 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  48.08 
 
 
622 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  28.76 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  23.94 
 
 
1269 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  26.34 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  24.42 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  46 
 
 
450 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  42 
 
 
417 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  27.57 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>