134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0482 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
285 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  60.56 
 
 
285 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  57.54 
 
 
286 aa  358  4e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  57.5 
 
 
302 aa  338  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  51.41 
 
 
286 aa  314  9e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
295 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  43.11 
 
 
381 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  44.44 
 
 
288 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
302 aa  228  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  41.42 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  41.98 
 
 
303 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  40.39 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  42.12 
 
 
301 aa  203  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  39.64 
 
 
306 aa  176  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  34.05 
 
 
316 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  37.23 
 
 
298 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  36.88 
 
 
298 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  35.64 
 
 
292 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  36.88 
 
 
298 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  36.63 
 
 
306 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  36.5 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  36.73 
 
 
306 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  34.18 
 
 
320 aa  158  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  35.34 
 
 
294 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  33.33 
 
 
299 aa  155  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  34.93 
 
 
526 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  30.28 
 
 
422 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  30.54 
 
 
405 aa  146  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  32.95 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  27.96 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  28.12 
 
 
264 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  28.84 
 
 
254 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  29.51 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  32.74 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  30.08 
 
 
334 aa  95.9  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  32.87 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  30.73 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
268 aa  87  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  31.1 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  33.18 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  30.52 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  27.88 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  28.64 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  29.15 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  29.41 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  32.54 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  32.37 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  35.29 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  29.57 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  33.53 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  29.95 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  30.43 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  31.4 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  30.43 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  32.06 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  31.43 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  30.52 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  28.17 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  31.94 
 
 
286 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  30.95 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  28.14 
 
 
622 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  24.88 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  24.07 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.43 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  30.12 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  31.5 
 
 
495 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  39.68 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  28.99 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  28.16 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  30.05 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  30.92 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  29.77 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  25.79 
 
 
1269 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  31.2 
 
 
387 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  32.31 
 
 
558 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  35.14 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  30.92 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>