134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0170 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  50.39 
 
 
260 aa  254  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  50.59 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  52.92 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  50.61 
 
 
258 aa  234  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  51.69 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  47.62 
 
 
291 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
261 aa  221  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  45.65 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  45.82 
 
 
291 aa  218  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  46.48 
 
 
288 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  48.64 
 
 
241 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
273 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
273 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  40.86 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  42.99 
 
 
259 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  40.25 
 
 
254 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  45.29 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  40.44 
 
 
254 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  42.92 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
270 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  41.07 
 
 
268 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  40 
 
 
266 aa  157  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
266 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  37.12 
 
 
375 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  39.29 
 
 
622 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  39.81 
 
 
248 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  37.74 
 
 
558 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  33.6 
 
 
626 aa  148  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  35.34 
 
 
1269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  35.65 
 
 
495 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  33.79 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  35.24 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  30.32 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  33.79 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  37.04 
 
 
297 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  32.73 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  36.11 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  33.18 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  33.95 
 
 
285 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  33.95 
 
 
285 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  34.25 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  35.65 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  32.87 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  36.11 
 
 
297 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  33.18 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  36.11 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  31.67 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  35.35 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  35.35 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  34.88 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  33.17 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  33.02 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  33.91 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  32.42 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  32.42 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  32.42 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  32.42 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  35.81 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  30.84 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  33.49 
 
 
285 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  35.35 
 
 
308 aa  89  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  34.76 
 
 
286 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  32.55 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  33.02 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  33.98 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  31.46 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  37.06 
 
 
299 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  35.81 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  34.8 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  33.19 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  36.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  30.28 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  34.6 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  34.47 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  30.73 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  33.65 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  33.65 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  33.65 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  33.18 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  33.48 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  31.07 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  33.03 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  32.85 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  35.07 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  31.08 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  33.02 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  35.07 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  32.26 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  35.07 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  32.14 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  29.27 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  33.02 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  28.33 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  28.95 
 
 
405 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  25.59 
 
 
422 aa  77  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>