42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  98.36 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  76.23 
 
 		 244 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  76.23 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  75 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  75 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  75 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  75 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  73.36 
 
 		 244 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  68.85 
 
 		 244 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  73.54 
 
 		 246 aa  332  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  28.63 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  28.02 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  27.31 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.56 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  27.31 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  27.69 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  27.59 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  28.51 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  30.25 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  29.01 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  34.21 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  30.43 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  34.21 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  30 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  31.15 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  31.15 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  29.33 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  28.65 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  29.29 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.47 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.39 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  33.72 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  24.66 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  23.5 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  27.68 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.75 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  31.31 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  28.51 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  25.85 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.93 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>