34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3689 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  58.56 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  57.47 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  57.14 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  57.01 
 
 		 232 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  57.14 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  56.56 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  52.94 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  52.27 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  51.36 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  48.44 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  52.29 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  49.75 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  41.44 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  42.58 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  42.58 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  40.99 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  34.91 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  35.62 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  35.27 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  34.78 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  34.43 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  35.05 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  35.51 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  35.05 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  35.05 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  34.76 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  34.25 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>