32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4949 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  97.86 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  54.87 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  52.86 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  53.54 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  52.42 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  54.22 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  50.21 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  50 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  50.23 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  41.36 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  47.3 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  40.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  37.95 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  35.96 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  37.76 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  37.81 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  39.13 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  39.13 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  36.48 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  35.84 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  36.04 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  35.43 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  34.39 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>