48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2534 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  99.54 
 
 
216 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  98.15 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  98.15 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  46.41 
 
 
232 aa  191  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  40.95 
 
 
234 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  42.25 
 
 
240 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  41.96 
 
 
232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  41.96 
 
 
232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  41.96 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  41.52 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  40.91 
 
 
240 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  43.01 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  39.81 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  41.27 
 
 
234 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  40.21 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  31.44 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  31.75 
 
 
259 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  33.85 
 
 
247 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  31.18 
 
 
250 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  31.98 
 
 
250 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  30.14 
 
 
250 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  32.95 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  32.95 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  31.87 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.01 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  29.41 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4055  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.48 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.01 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3839  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.48 
 
 
265 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000421355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  28.57 
 
 
265 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  28.57 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  28.57 
 
 
265 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0081  lipopolysaccharide kinase  27.48 
 
 
265 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382008  hitchhiker  0.000743328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4131  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.48 
 
 
265 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00183874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03439  hypothetical protein  27.48 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3965  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.48 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03487  kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide  27.48 
 
 
268 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.48 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.120387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  25.83 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  25.51 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>