32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0943 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  99.57 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  96.55 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  92.64 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  67.86 
 
 		 237 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  63.04 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  64.57 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  57.01 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  52.86 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  52.42 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  53.42 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  50.43 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  48.17 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  41.96 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  36.82 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  35.09 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  37.21 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  37.16 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  34.7 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  36.74 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  34.84 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  34.93 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  34.86 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  33.95 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  33.95 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>