32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4371 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  92.08 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  70.17 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  65.33 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  65.07 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  64.57 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  62.61 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  57.14 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  50.84 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  50 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  48.62 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  48.44 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  48.44 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  42.72 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  42.52 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  42.52 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  42.25 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  42.25 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  42.25 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  42.25 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  42.25 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  35.75 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  35.29 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  35.11 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  34.39 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  35.81 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  35.05 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  35.38 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  35.32 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  37.26 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  34.21 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  34.21 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>