37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0584 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  67.6 
 
 		 250 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  66.8 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  66.4 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  66.4 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  66 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  69.42 
 
 		 252 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  69.83 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  63.97 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  63.56 
 
 		 253 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  37.95 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  37.44 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  37.09 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  37.61 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  36.57 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  37.16 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  36.7 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  33.18 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  33.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  34.91 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  35.48 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  35.38 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  36.21 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  31.16 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  32.2 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  29.25 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  33.64 
 
 		 422 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  25 
 
 		 286 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  25.65 
 
 		 287 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>