32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  97.86 
 
 
234 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  54.42 
 
 
232 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  53.1 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  52.42 
 
 
232 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  51.98 
 
 
233 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  54.67 
 
 
240 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  50.21 
 
 
237 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  50.84 
 
 
240 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  51.36 
 
 
234 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  49.3 
 
 
232 aa  204  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  40.45 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  46.64 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  41.8 
 
 
216 aa  157  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  41.27 
 
 
216 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  37.44 
 
 
247 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  37.24 
 
 
250 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  35.47 
 
 
259 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  37.31 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  38.65 
 
 
250 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  38.65 
 
 
250 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  36.05 
 
 
250 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  35.43 
 
 
252 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  35.59 
 
 
250 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  34.98 
 
 
252 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  34.39 
 
 
253 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>