28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0583 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  69.67 
 
 		 244 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  68.44 
 
 		 244 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  68.85 
 
 		 244 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  68.03 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  68.44 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  68.85 
 
 		 244 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  69.26 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  69.26 
 
 		 244 aa  351  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  69.26 
 
 		 244 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  72.65 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  28.21 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  23.67 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  30.54 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  27.53 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  27.53 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  27.53 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  28.19 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  29.18 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  25.87 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.38 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  29.01 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  29.61 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  30.53 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  29.19 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.5 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  27.84 
 
 		 277 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  28.14 
 
 		 286 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>