265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1777 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1777  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
620 aa  1181    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00817012  normal  0.221734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3136  serine/threonine protein kinase  62.9 
 
 
572 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.295772  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1922  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 
599 aa  74.7  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0873798  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  36.91 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1600  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 
562 aa  67  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000058478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
461 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
607 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
583 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
783 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
562 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
444 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
535 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
1029 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
531 aa  62.4  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1606  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
561 aa  62  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
707 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  36.15 
 
 
443 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
525 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  32.37 
 
 
477 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
612 aa  61.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13350  protein kinase family protein  39.78 
 
 
561 aa  61.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 
583 aa  61.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
480 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.32 
 
 
715 aa  61.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.54 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
703 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  35.53 
 
 
501 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
578 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 
481 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  36.36 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
614 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
316 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3281  protein kinase  29.18 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.525324  normal  0.210177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
596 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
581 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2032  hypothetical protein  51.69 
 
 
497 aa  58.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682699  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
419 aa  58.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
487 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
490 aa  58.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
418 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
563 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
540 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.29 
 
 
505 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
721 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
535 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0191  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
494 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
391 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.36 
 
 
682 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  32.89 
 
 
575 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  33.11 
 
 
621 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
460 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0931  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
543 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.30493  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.27 
 
 
621 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
411 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.04 
 
 
499 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
776 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.41 
 
 
951 aa  55.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
524 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
497 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  30.05 
 
 
436 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3401  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
460 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
528 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2103  hypothetical protein  38.36 
 
 
459 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216952  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3363  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
566 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.27 
 
 
445 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.03 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
776 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.69 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
571 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  30.54 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  29.56 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35576  predicted protein  27.46 
 
 
382 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98269  normal  0.38201 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  29.48 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
638 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
641 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
585 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 
554 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 
1479 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
567 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
301 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
673 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
450 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.94 
 
 
596 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.37 
 
 
593 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
595 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
464 aa  51.6  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
468 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
594 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.49 
 
 
603 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
617 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
445 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>