More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3136 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3136  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 572 aa  1076    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.295772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1777  serine/threonine protein kinase  62.9 
 
 		 620 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00817012  normal  0.221734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1606  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1600  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000058478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13350  protein kinase family protein  45.56 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 607 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.97 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 716 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  33.07 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1065  serine/threonine protein kinase  39.2 
 
 		 577 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  36.57 
 
 		 1029 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3401  serine/threonine protein kinase  42.57 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0931  serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.30493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  27.68 
 
 		 574 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2103  hypothetical protein  52.44 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  39.78 
 
 		 1110 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3363  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  31.84 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  41 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  38 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  29.03 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  30.32 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.7 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.64 
 
 		 667 aa  57  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 316 aa  57  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  30.88 
 
 		 575 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1818 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 578 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 612 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.7 
 
 		 715 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.71 
 
 		 889 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.59 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 		 661 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1607  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.45 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 585 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 776 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 790 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  25.23 
 
 		 692 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.63 
 
 		 916 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 703 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 894 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35576  predicted protein  25.82 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98269  normal  0.38201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  29.71 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  36 
 
 		 1183 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.21 
 
 		 587 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.32 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.62 
 
 		 932 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 502 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 596 aa  54.3  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.03 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 461 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.22 
 
 		 614 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 641 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 661 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 525 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 		 617 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  30.41 
 
 		 501 aa  53.9  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>