More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2673 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
540 aa  1061    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  51.82 
 
 
531 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  49.19 
 
 
563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3142  serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 
499 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0617984  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2518  serine/threonine protein kinase  48.43 
 
 
505 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1514  serine/threonine protein kinase  44.79 
 
 
505 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  53.16 
 
 
297 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 
518 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0957  serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 
523 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
557 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
591 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  40.23 
 
 
593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  35.69 
 
 
614 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  38.41 
 
 
951 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.69 
 
 
642 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  37.89 
 
 
638 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 
894 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.31 
 
 
614 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.25 
 
 
599 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.33 
 
 
692 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.59 
 
 
647 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
691 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.11 
 
 
662 aa  177  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
398 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40 
 
 
740 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.1 
 
 
620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.61 
 
 
825 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
653 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.82 
 
 
598 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.78 
 
 
650 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  39.92 
 
 
403 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
642 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.24 
 
 
681 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
646 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
668 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
538 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
468 aa  170  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
596 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.43 
 
 
715 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.84 
 
 
666 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.31 
 
 
700 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
723 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
703 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
614 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.35 
 
 
718 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.29 
 
 
602 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
721 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
614 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.45 
 
 
632 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  39.69 
 
 
501 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.05 
 
 
621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  38.37 
 
 
399 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  39.2 
 
 
625 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  34.18 
 
 
634 aa  166  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 
368 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
681 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.68 
 
 
662 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
651 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.4 
 
 
647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.31 
 
 
635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 
691 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
651 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
610 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 
464 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 
663 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
382 aa  165  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
624 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
624 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.54 
 
 
662 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.31 
 
 
1044 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
624 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.97 
 
 
681 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
619 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.22 
 
 
693 aa  164  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.88 
 
 
562 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.59 
 
 
627 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
625 aa  163  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
411 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.67 
 
 
601 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
559 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.66 
 
 
445 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
843 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
763 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 
666 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.72 
 
 
667 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
563 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
674 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
573 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  40.49 
 
 
658 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.98 
 
 
863 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.46 
 
 
641 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
468 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
773 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.16 
 
 
676 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>