123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0128 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.5 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  31.74 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  27.32 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  30.73 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  28.02 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  23.03 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  26.2 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  23.71 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  27.55 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0904  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 238 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 198 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>