137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 108 aa  212  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  58.76 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  58.59 
 
 		 101 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  61.29 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  58.95 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  64.29 
 
 		 179 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  59.09 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 122 aa  97.1  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  60.98 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  55.29 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  54 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  57.45 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  54.35 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  65.71 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  61.76 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 245 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  61.64 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  56.34 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  47.37 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  53.95 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  61.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  47.95 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 277 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  51.85 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 283 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 325 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  31.52 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  28.71 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  28.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  31.08 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  31.08 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>