More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2540 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  43.94 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.16 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  41.03 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>