205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22240 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 619 aa  1265    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.57 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  37.39 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.24 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.39 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  29.71 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  28.99 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.24 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  34.21 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  29.63 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.32 
 
 		 840 aa  62  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  33.07 
 
 		 304 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  26.89 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  34.65 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  28.26 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  27.92 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  28.26 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  36.84 
 
 		 881 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  27.54 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  27.54 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  27.54 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  27.54 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.37 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  28.03 
 
 		 1556 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.36 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.09 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.65 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  28.86 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  35.85 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  26.28 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.63 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  28.26 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  27.54 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  34.45 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  25.41 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.2 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  28.89 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  33.64 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  31.73 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  30.65 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.6 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.4 
 
 		 515 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.4 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  34.83 
 
 		 261 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35.29 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  32.32 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.4 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.4 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  33.72 
 
 		 428 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.4 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.4 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.69 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  26.11 
 
 		 346 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  27.54 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  30 
 
 		 289 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  23.42 
 
 		 620 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  33.7 
 
 		 596 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  32.23 
 
 		 271 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 849 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 523 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.22 
 
 		 406 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.22 
 
 		 406 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.09 
 
 		 277 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  35.42 
 
 		 278 aa  54.7  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.01 
 
 		 419 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.66 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  30.41 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  21.38 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  24.65 
 
 		 539 aa  53.9  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  34.65 
 
 		 403 aa  54.3  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  28.26 
 
 		 342 aa  53.9  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.67 
 
 		 257 aa  53.9  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 661 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  24.65 
 
 		 467 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 342 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>