More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1307 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 406 aa  802    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  77.34 
 
 		 407 aa  641    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  73.67 
 
 		 407 aa  594  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  71.32 
 
 		 410 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  74.11 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  65.63 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  64.57 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  62.63 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  61.92 
 
 		 405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  61.86 
 
 		 405 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  58.08 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  52.76 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  52.97 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  53.54 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  49.86 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  51.66 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  51.34 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  50.95 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  54.24 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  54.87 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  47.93 
 
 		 436 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  50.68 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  50.13 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  48.95 
 
 		 412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.25 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  50.41 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  49.46 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  47.24 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.87 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  46.19 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  47.59 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  47.03 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  45.36 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  41.3 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  42.71 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  49.67 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45.43 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.75 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  49.17 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.29 
 
 		 460 aa  298  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  51.03 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50.35 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  44.62 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  48.08 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.32 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  42.36 
 
 		 414 aa  289  6e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  45.91 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.65 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  42.7 
 
 		 417 aa  289  8e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.93 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.38 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.83 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.8 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  40.68 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  44.69 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  42.22 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  40.86 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  47.74 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  40.37 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  46.85 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  42.18 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.62 
 
 		 431 aa  268  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  39.18 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.81 
 
 		 754 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.63 
 
 		 754 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.51 
 
 		 757 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.96 
 
 		 754 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.69 
 
 		 754 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.74 
 
 		 742 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.3 
 
 		 740 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.74 
 
 		 742 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.86 
 
 		 743 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.8 
 
 		 732 aa  239  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.62 
 
 		 731 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.05 
 
 		 763 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.45 
 
 		 739 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.25 
 
 		 740 aa  239  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  50.19 
 
 		 754 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.62 
 
 		 731 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.11 
 
 		 718 aa  237  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.48 
 
 		 769 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  49.2 
 
 		 703 aa  236  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.87 
 
 		 731 aa  236  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.86 
 
 		 805 aa  236  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.39 
 
 		 738 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.64 
 
 		 727 aa  236  7e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.97 
 
 		 768 aa  235  9e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.87 
 
 		 731 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.19 
 
 		 719 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.27 
 
 		 756 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 721 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.98 
 
 		 798 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  50.39 
 
 		 776 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  47.43 
 
 		 739 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45 
 
 		 723 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.77 
 
 		 738 aa  230  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  46.79 
 
 		 632 aa  230  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  46.1 
 
 		 713 aa  229  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 804 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>