More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0126 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  60.22 
 
 
767 aa  839    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0126  type II secretion system protein E  100 
 
 
737 aa  1481    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721545  normal  0.429419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  28.64 
 
 
510 aa  152  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  31.35 
 
 
551 aa  145  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
556 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
991 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  32.87 
 
 
591 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  27.84 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  30.67 
 
 
692 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  30.53 
 
 
547 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  26.48 
 
 
671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  25.46 
 
 
489 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  30.09 
 
 
583 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  30.17 
 
 
549 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  26.88 
 
 
519 aa  125  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  30.34 
 
 
558 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  24.67 
 
 
797 aa  124  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.7 
 
 
473 aa  118  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  28.23 
 
 
557 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  27.52 
 
 
791 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.28 
 
 
654 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  27.81 
 
 
640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  30.63 
 
 
491 aa  115  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  28.45 
 
 
749 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  24.82 
 
 
549 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
557 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
546 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
546 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  26.73 
 
 
546 aa  111  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
628 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  27 
 
 
682 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  26.42 
 
 
557 aa  108  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  23.58 
 
 
545 aa  108  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  30 
 
 
492 aa  107  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  30 
 
 
612 aa  107  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
492 aa  107  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.32 
 
 
594 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  28.99 
 
 
1319 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
847 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  25.18 
 
 
543 aa  105  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
547 aa  105  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
831 aa  104  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  28.99 
 
 
1335 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  29.35 
 
 
1255 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  26.68 
 
 
557 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  24.28 
 
 
722 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  27.76 
 
 
577 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  25.37 
 
 
609 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  25.92 
 
 
559 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
572 aa  99.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.3 
 
 
441 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  24.48 
 
 
770 aa  99.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  28.41 
 
 
549 aa  99  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  24.59 
 
 
476 aa  98.6  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.25 
 
 
440 aa  97.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  27.41 
 
 
482 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30 
 
 
442 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  27.11 
 
 
482 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.7 
 
 
408 aa  97.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  28.85 
 
 
624 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30 
 
 
408 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.82 
 
 
412 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  27.88 
 
 
634 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  27.6 
 
 
563 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
311 aa  95.1  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  27.84 
 
 
482 aa  94.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  27.47 
 
 
485 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  27.57 
 
 
480 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  29.32 
 
 
478 aa  94.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  28.28 
 
 
444 aa  94  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.04 
 
 
444 aa  94  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  30.19 
 
 
440 aa  94  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  28.16 
 
 
474 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.71 
 
 
483 aa  94  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.02 
 
 
453 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  30.38 
 
 
451 aa  93.2  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0031  type II secretion system protein E  29.39 
 
 
494 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  27.47 
 
 
482 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  26.67 
 
 
513 aa  92.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  26.46 
 
 
504 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  30.77 
 
 
438 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  26.05 
 
 
483 aa  92  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  28.8 
 
 
515 aa  92  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.69 
 
 
438 aa  92  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.21 
 
 
473 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  27.07 
 
 
512 aa  91.3  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  26.88 
 
 
508 aa  91.3  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  28.2 
 
 
449 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
449 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
454 aa  90.9  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  31.01 
 
 
469 aa  90.5  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
469 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  31.1 
 
 
455 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  26.07 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  27.41 
 
 
416 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.06 
 
 
460 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  27.94 
 
 
492 aa  89.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
463 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
608 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>