More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0200 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  65.7 
 
 		 208 aa  261  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  66 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  65.85 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  48.28 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  43.48 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  43.56 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  41 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.5 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  44.76 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 205 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  43.14 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.78 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  42.21 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.02 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  45.32 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  43.9 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.23 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  37.76 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  47.95 
 
 		 211 aa  140  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  40.28 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  43.66 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.22 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  40.49 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  39.52 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 238 aa  134  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>