More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3921 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  100 
 
 
360 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  54.55 
 
 
291 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  54.93 
 
 
299 aa  299  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  52.1 
 
 
306 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  46.75 
 
 
316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  41.75 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  42.37 
 
 
300 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  39.22 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  40.46 
 
 
321 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  44.17 
 
 
305 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  46.43 
 
 
312 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  42.71 
 
 
304 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  47.27 
 
 
427 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  43.88 
 
 
298 aa  225  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  41.75 
 
 
307 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  41.49 
 
 
424 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  46.78 
 
 
303 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  46.79 
 
 
321 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  42.61 
 
 
322 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  48.39 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  39.64 
 
 
311 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  40.58 
 
 
321 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  39.51 
 
 
370 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  36.86 
 
 
324 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  42.96 
 
 
299 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  40.2 
 
 
393 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  41.49 
 
 
323 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  45.68 
 
 
326 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  41.61 
 
 
301 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  41.26 
 
 
329 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  41.26 
 
 
329 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  40.79 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  36.54 
 
 
310 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  39.25 
 
 
311 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  39.25 
 
 
314 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  39.25 
 
 
314 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  37.54 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  39.54 
 
 
308 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  41.37 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.57 
 
 
443 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  37.08 
 
 
436 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  33.33 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  40.64 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  37.07 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  36.26 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  37.07 
 
 
304 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  37.07 
 
 
307 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  37.07 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  37.07 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  37.07 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  34.51 
 
 
311 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  36.76 
 
 
411 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  35.27 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.96 
 
 
320 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  37.16 
 
 
292 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  37.16 
 
 
292 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.82 
 
 
331 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  31.73 
 
 
294 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.27 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  32.96 
 
 
276 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.93 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.79 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  29.61 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  29.41 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.8 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  30.18 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  37.29 
 
 
368 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.07 
 
 
309 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  27.46 
 
 
306 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  32.84 
 
 
305 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  32.84 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  28.77 
 
 
322 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  28.77 
 
 
322 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  27.11 
 
 
302 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  26.49 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.76 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  28.47 
 
 
294 aa  89.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.65 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  28.26 
 
 
262 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.05 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.2 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.85 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.98 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.78 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.14 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.87 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.28 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  28.52 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  28.52 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  24.42 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.34 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.34 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.51 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.25 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.3 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.3 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>