251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1116 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  61.01 
 
 		 182 aa  173  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 207 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  38.75 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 210 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 212 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 219 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 243 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  34.87 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 195 aa  84  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  36.3 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  36.59 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  31.17 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.76 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.54 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  29.49 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  33.13 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  28.22 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  32.61 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  28.3 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  28.03 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32.82 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  26.45 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  27.01 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  31.16 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  28.08 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  30.95 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  34.81 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.69 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  34.35 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  26.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  26.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  26.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  29.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  30.6 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  26.53 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  28.47 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  25.85 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  31.74 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  30.22 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  32.1 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  32.37 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  32.81 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  30.66 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>