More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0737 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
644 aa  1311    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
802 aa  249  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.9 
 
 
726 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
662 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
662 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  29.65 
 
 
795 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
663 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
662 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  25.66 
 
 
715 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  27.27 
 
 
668 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  26.81 
 
 
724 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 
782 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.1 
 
 
708 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2507  sensor histidine kinase  46.25 
 
 
635 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  27.01 
 
 
677 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  48.54 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  41.57 
 
 
609 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25 
 
 
707 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  26.67 
 
 
730 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.94 
 
 
696 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  28.92 
 
 
603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  27.54 
 
 
630 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.37 
 
 
914 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  25.59 
 
 
918 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  24.76 
 
 
918 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2227  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
665 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.670404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 
749 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  41.91 
 
 
1154 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  31.91 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  28.53 
 
 
564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.74 
 
 
634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.9 
 
 
819 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.67 
 
 
660 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
545 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  28.53 
 
 
588 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  33.82 
 
 
1258 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.1 
 
 
516 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  34.88 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
804 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.25 
 
 
541 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
630 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  35.66 
 
 
1092 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.43 
 
 
716 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
819 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  36.55 
 
 
853 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
680 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  23.81 
 
 
914 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  35.37 
 
 
621 aa  137  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  24.73 
 
 
739 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1262 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
655 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.91 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
655 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  28.24 
 
 
638 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
691 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.26 
 
 
614 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  27.16 
 
 
612 aa  133  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.48 
 
 
611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
1034 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  24.13 
 
 
979 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
656 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
801 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.25 
 
 
542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  31.67 
 
 
548 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
492 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  25.46 
 
 
955 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
852 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
671 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
394 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  35.18 
 
 
656 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
780 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  33.2 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3728  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.91 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
475 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  34.85 
 
 
737 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  32.81 
 
 
395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
548 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.32 
 
 
531 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
655 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.69 
 
 
1042 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.33 
 
 
1258 aa  127  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  34.5 
 
 
852 aa  127  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  32.54 
 
 
394 aa  126  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.67 
 
 
600 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
714 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  33.46 
 
 
483 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.73 
 
 
952 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  32.69 
 
 
517 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
494 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
661 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  31.62 
 
 
566 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
919 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>