157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0837 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0837  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 285 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2758  TPR repeat-containing protein  51.03 
 
 		 414 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0951  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.73 
 
 		 330 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0214706  normal  0.0588127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  45.1 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 599 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.54 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 878 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.02 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 909 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.6 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.86 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  32.56 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 632 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  41 
 
 		 864 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 451 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 1005 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.77 
 
 		 626 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.56 
 
 		 764 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 465 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.59 
 
 		 725 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 688 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 453 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.34 
 
 		 626 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.34 
 
 		 626 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.23 
 
 		 1034 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 523 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.34 
 
 		 614 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.34 
 
 		 614 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 614 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 614 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 614 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 543 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 739 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  32.95 
 
 		 661 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  40.86 
 
 		 623 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 602 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 589 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 472 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 927 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 573 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.64 
 
 		 1694 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 750 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 391 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 542 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 1020 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.15 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 3035 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3247  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.48 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405912  normal  0.391395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 639 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  39.42 
 
 		 620 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 		 502 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.13 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 502 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 366 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  39.81 
 
 		 503 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 637 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2305  hypothetical protein  36.96 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.63 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.13 
 
 		 725 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 708 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.1 
 
 		 865 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.61 
 
 		 587 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 828 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.32 
 
 		 795 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 339 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 620 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 636 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 1049 aa  45.8  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 1450 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 875 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 700 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 538 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  41.38 
 
 		 695 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 955 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 610 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>