More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2208 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  74.89 
 
 		 458 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  75.65 
 
 		 465 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  74.67 
 
 		 460 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 460 aa  967    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  39.87 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  38.95 
 
 		 461 aa  352  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  37.47 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  39.95 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  40.1 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  36.22 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 		 486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  35.02 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  36.55 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  35.63 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  35.63 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  34.9 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  36.18 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  33.57 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  31.56 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.64 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.06 
 
 		 346 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.22 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 325 aa  87.8  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  27.56 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.5 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.27 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.45 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.09 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.22 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  29.71 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.18 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.59 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.09 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.52 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  25.35 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.26 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.73 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  23.28 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.75 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  25.91 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.52 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26.6 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.68 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>