175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4014 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  97.34 
 
 		 376 aa  766    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 376 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  52.42 
 
 		 460 aa  378  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  49.87 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  49.87 
 
 		 814 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  49.87 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  48.79 
 
 		 383 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  48.79 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  48.66 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  48.65 
 
 		 399 aa  358  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  50.51 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  46.51 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 		 783 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  47.14 
 
 		 363 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  46.36 
 
 		 783 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  46.32 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  46.19 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  44.57 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.53 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  43.41 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  41.67 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  42.06 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  44.03 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44.5 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  43.83 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.31 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  41.89 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.4 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  43.88 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  41.9 
 
 		 399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  41.9 
 
 		 399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  41.42 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  41.9 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  41.42 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  41.75 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  41.3 
 
 		 413 aa  272  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  38.8 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  41.64 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  39.25 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  40.87 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.56 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  39.67 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  40.91 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.2 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  40.54 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  38.17 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  37.37 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  37.98 
 
 		 365 aa  253  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  39.43 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  38.04 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  35.7 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  38.23 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.42 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.07 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  64.29 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  61.9 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  24.25 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.29 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  52.38 
 
 		 476 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  28.66 
 
 		 496 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  27.04 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  35.24 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  35.06 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  40.32 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  40.32 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  32.03 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  42.62 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  38.71 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  40.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>