More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1987 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 552 aa  1142    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  97.1 
 
 		 552 aa  1111    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  67.39 
 
 		 552 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  69.02 
 
 		 552 aa  780    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  56.1 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.15 
 
 		 819 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 862 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 853 aa  198  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 819 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 801 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 852 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 531 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.59 
 
 		 1092 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 844 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 852 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 970 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 408 aa  177  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 842 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 804 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  29.92 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  37.15 
 
 		 1061 aa  167  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 402 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  36.22 
 
 		 1062 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.42 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 655 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  30.05 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 677 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.47 
 
 		 952 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 642 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 662 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 656 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 701 aa  160  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  35.04 
 
 		 656 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 897 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 649 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 760 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 642 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 753 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  38.37 
 
 		 647 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 683 aa  157  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 588 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  36.1 
 
 		 673 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 702 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 752 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  35.2 
 
 		 313 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  28.12 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 954 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 990 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  26.82 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 803 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 682 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  38.11 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 795 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 872 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1262 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.21 
 
 		 1255 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 592 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 691 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 672 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 655 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 394 aa  153  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 674 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.59 
 
 		 1258 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 850 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 655 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 853 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 686 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 630 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 840 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  35.68 
 
 		 912 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1222 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 702 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  35.56 
 
 		 749 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.61 
 
 		 631 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 859 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 650 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  38.56 
 
 		 661 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  36.13 
 
 		 542 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 850 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  29.51 
 
 		 1561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 753 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 726 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.04 
 
 		 823 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>