More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0774 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4432  regulatory protein GntR HTH  40.4 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  41.5 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4717  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4496  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4728  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4343  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4847  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0525  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4733  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4331  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4712  transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.53 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  35.88 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.73 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  33.9 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  33.9 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.12 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  40.34 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.63 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  39.84 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.84 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.5 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  36.08 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  28.5 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  28.5 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  28.5 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  28.5 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  29 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  36.52 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  39.52 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.95 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  30.77 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.93 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.24 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  30.58 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.5 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  28 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  32.91 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  36.43 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.3 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.98 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  35.76 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  27.67 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  28.16 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  32.91 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  32 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  30.13 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  42.27 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  33.86 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.12 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  37.16 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  31.46 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  30.91 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  38.89 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  30.72 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  30.86 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  35.83 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.36 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>