More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4432 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4432  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4496  GntR family transcriptional regulator  94.86 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4343  GntR family transcriptional regulator  94.86 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4847  GntR family transcriptional regulator  94.86 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4717  transcriptional regulator, GntR family  94.86 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4728  transcriptional regulator, GntR family  94.86 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4733  GntR family transcriptional regulator  93.93 
 
 
214 aa  410  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4331  GntR family transcriptional regulator  94.39 
 
 
214 aa  410  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0525  transcriptional regulator, GntR family  93.93 
 
 
214 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4712  transcriptional regulator, GntR family  93.65 
 
 
189 aa  364  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  84.88 
 
 
205 aa  350  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  40.4 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
233 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.2 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  44.86 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  41.12 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.02 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.02 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.16 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  40.62 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  39.01 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.51 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  39.25 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.06 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.33 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.58 
 
 
249 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  29.38 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.94 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.58 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  32.32 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.53 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  37.04 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  37.4 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  33.54 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  29.91 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  38.71 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.08 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  27.91 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  25.25 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  33.59 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.1 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  33.98 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  31.58 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  30.36 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  24.66 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.09 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.37 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  42.25 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  25.84 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.36 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  36.84 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.36 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.36 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  29 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  45.59 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  25 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  28.78 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>