More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4084 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  39.73 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.17 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  33.61 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.17 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.17 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.17 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.25 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.23 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.25 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.25 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  44.09 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.41 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.41 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.53 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28.7 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.85 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40.62 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  31.86 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.83 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  31.86 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  36.27 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  28.7 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>