108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2689 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 186 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.54 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 470 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.46 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  23.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  23.21 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  50 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  50 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  23.31 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5275  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.398681  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  49.02 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  38.16 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 192 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 249 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  27.33 
 
 		 182 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 216 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 191 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 218 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 222 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>