More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0475 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.53 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  43.11 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
155 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.24 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.2 
 
 
169 aa  111  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.92 
 
 
156 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  52.29 
 
 
163 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.86 
 
 
170 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
156 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
161 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.31 
 
 
157 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.87 
 
 
158 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  39.16 
 
 
164 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.41 
 
 
174 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.08 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  39.51 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.03 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.69 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.22 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  38.64 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.89 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.09 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.99 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.33 
 
 
167 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.96 
 
 
171 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.5 
 
 
151 aa  91.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.25 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  59.46 
 
 
79 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 
171 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.51 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.15 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.25 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.93 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  40.26 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.73 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  39.57 
 
 
136 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.05 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.31 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  56.34 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.94 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.14 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  32.98 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.41 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.57 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  31.93 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.37 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  53.12 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  47.56 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.07 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  32.91 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
48 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  59.32 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  45.59 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  79.49 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  45.59 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  53.23 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  67.5 
 
 
134 aa  61.6  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  63.41 
 
 
634 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  26.38 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  37.07 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.18 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  39.39 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  53.85 
 
 
527 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  38.24 
 
 
208 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  43.96 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  43.96 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  39.76 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  36.56 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  45.45 
 
 
140 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.53 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.33 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  58.54 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.75 
 
 
142 aa  57.4  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  42.25 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  43.55 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  52.94 
 
 
567 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  60 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  32.06 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.43 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  42.65 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42.19 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  50 
 
 
548 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  40.3 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.86 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  43.04 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  41.79 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  43.28 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.3 
 
 
138 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.58 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  46.3 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>