More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0102 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0102  type II secretion system protein  100 
 
 
350 aa  707    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  25.81 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.07 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  26.24 
 
 
401 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  26.39 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.97 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  27.71 
 
 
405 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  29.97 
 
 
409 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.16 
 
 
401 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  26.61 
 
 
403 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  26.82 
 
 
403 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  25.56 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.43 
 
 
405 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  27.38 
 
 
412 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  27.03 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  24.3 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  24.5 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  29.71 
 
 
409 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  26.45 
 
 
409 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  29.59 
 
 
409 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  29.59 
 
 
409 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  26.8 
 
 
416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.61 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  24.02 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  24.64 
 
 
401 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  28.19 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  25.78 
 
 
411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  25.72 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  26.38 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  25.29 
 
 
401 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.46 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  25 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  24.44 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.65 
 
 
405 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  26.57 
 
 
405 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  25.07 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  25.43 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  25.43 
 
 
417 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  28.77 
 
 
406 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  25.8 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.67 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  25.65 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  25.43 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  27.02 
 
 
405 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  27.43 
 
 
417 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.75 
 
 
422 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.43 
 
 
417 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  23.21 
 
 
406 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  25.57 
 
 
405 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  25.83 
 
 
407 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  26.93 
 
 
410 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  26.88 
 
 
417 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  26.44 
 
 
405 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  26.06 
 
 
373 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.37 
 
 
412 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.43 
 
 
402 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  26.48 
 
 
403 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  23.7 
 
 
404 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.73 
 
 
423 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  27.86 
 
 
404 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  23.85 
 
 
402 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  24.85 
 
 
401 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  28.03 
 
 
423 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  23.68 
 
 
401 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.82 
 
 
419 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  26.4 
 
 
397 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.63 
 
 
423 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  24.64 
 
 
404 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  24.64 
 
 
404 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  25.57 
 
 
404 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  25.7 
 
 
419 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  27.78 
 
 
401 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  28.03 
 
 
423 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  25.72 
 
 
407 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  24.7 
 
 
406 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  24.34 
 
 
407 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  26.21 
 
 
421 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  26.67 
 
 
405 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  24.65 
 
 
408 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  23.43 
 
 
408 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  25.28 
 
 
422 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  23.39 
 
 
406 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  24.56 
 
 
406 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  27.09 
 
 
421 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0580  type II secretion system protein  25.21 
 
 
412 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000819628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  22.35 
 
 
411 aa  99.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  26.45 
 
 
405 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  25 
 
 
419 aa  99.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  26.61 
 
 
409 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  23.56 
 
 
407 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  24.15 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  23.67 
 
 
403 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  25.43 
 
 
422 aa  99.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  26.55 
 
 
421 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  26.97 
 
 
419 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  25.43 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  25.42 
 
 
405 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  27.06 
 
 
412 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  24.86 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>