151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2426 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  89.8 
 
 		 575 aa  1036    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  89.8 
 
 		 575 aa  1036    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1205    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  62.05 
 
 		 598 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  61.2 
 
 		 593 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  50.43 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  51.52 
 
 		 566 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  44.91 
 
 		 571 aa  477  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  43.03 
 
 		 642 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  43.03 
 
 		 642 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  42.74 
 
 		 627 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  41.89 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  48.3 
 
 		 640 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  40.86 
 
 		 633 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  43.97 
 
 		 621 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  40.1 
 
 		 625 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  39.7 
 
 		 613 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  39.93 
 
 		 624 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  46.43 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  45.17 
 
 		 698 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  39.93 
 
 		 706 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  45.28 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  45.38 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  46.23 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  44.56 
 
 		 686 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  45.49 
 
 		 613 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  37.41 
 
 		 612 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.02 
 
 		 792 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  44.58 
 
 		 709 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  44.4 
 
 		 651 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  44.4 
 
 		 651 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  44.21 
 
 		 708 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  44.42 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  41.93 
 
 		 654 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  41.35 
 
 		 551 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  53.64 
 
 		 350 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  35.96 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  34.99 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  33.6 
 
 		 490 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 859 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  36.31 
 
 		 935 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  35.08 
 
 		 462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.91 
 
 		 416 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.95 
 
 		 479 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 412 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 430 aa  87  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.39 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.9 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.39 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.04 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.49 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.89 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.81 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.9 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.4 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  24.29 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.6 
 
 		 755 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.44 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.44 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.6 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  33.57 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  22.37 
 
 		 452 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  38.27 
 
 		 92 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  25.66 
 
 		 816 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  27.11 
 
 		 582 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.94 
 
 		 739 aa  53.9  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  24.64 
 
 		 757 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  21.39 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 		 419 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.17 
 
 		 722 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>