More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2227 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2227  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
665 aa  1333    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.670404  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
823 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.960526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
545 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  41.36 
 
 
513 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
819 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
819 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  41.31 
 
 
609 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  30.08 
 
 
853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
1062 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  35.94 
 
 
1154 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  30 
 
 
1061 aa  165  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
804 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
639 aa  158  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2507  sensor histidine kinase  43.65 
 
 
635 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
644 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
852 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
970 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
649 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.51 
 
 
1255 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
852 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1799  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
1150 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  30.27 
 
 
1092 aa  151  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.8 
 
 
952 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
981 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
683 aa  150  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.45 
 
 
917 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  25.71 
 
 
1379 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1106 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
557 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
637 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
712 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
516 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
1168 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 
1134 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
557 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
826 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1247 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
899 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  29.66 
 
 
1258 aa  144  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  28.84 
 
 
1268 aa  143  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.94 
 
 
1822 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
743 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
801 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  30.52 
 
 
1000 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
1651 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
1262 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
962 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  30.17 
 
 
737 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4860  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 
923 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  31.2 
 
 
975 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  29.9 
 
 
986 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
386 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
810 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  26.12 
 
 
787 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  28.26 
 
 
812 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
673 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
560 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
686 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55780  putative two-component sensor  30.85 
 
 
922 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
703 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  30.95 
 
 
984 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  25.27 
 
 
895 aa  137  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
921 aa  137  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
936 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
402 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
1646 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
861 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  38.11 
 
 
600 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.52 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.16 
 
 
1845 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
807 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  30.41 
 
 
982 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
643 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 
871 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 
1109 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
636 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
505 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
789 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
789 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  29.92 
 
 
699 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
677 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
576 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
1105 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
607 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
827 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
838 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
1432 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
395 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  30.08 
 
 
981 aa  133  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
551 aa  133  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
1279 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
985 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
982 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  35.6 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
1131 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>