More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2127 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  100 
 
 		 447 aa  937    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  62.78 
 
 		 451 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  61.52 
 
 		 478 aa  585  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  59.91 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  54.38 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  56.92 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  56.66 
 
 		 480 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  52.3 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  51.61 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  53.6 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  52.44 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  53.63 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  52.68 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  50.7 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  49.43 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  48.3 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  50.93 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  50.69 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  36.68 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  28.61 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  28.61 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  31.17 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  35.86 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  30.98 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 326 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.86 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.29 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.78 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.89 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  31.29 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.91 
 
 		 308 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.6 
 
 		 306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.18 
 
 		 379 aa  146  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 317 aa  146  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  30.77 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  31.76 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  42.11 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 426 aa  143  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  33.55 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.47 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.36 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  40.25 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  40.25 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.16 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  35.29 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  37.93 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  37.93 
 
 		 340 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  35.17 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.07 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  36.95 
 
 		 340 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.43 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.34 
 
 		 311 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.36 
 
 		 316 aa  140  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  33.1 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.5 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  35.06 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  31.43 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  33.1 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  37.93 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  37.93 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  37.93 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  37.93 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  30.12 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.62 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  35.1 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  30 
 
 		 341 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 365 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 309 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  33.8 
 
 		 330 aa  136  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  44.57 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  36.32 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.52 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  35.48 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  43.41 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.01 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.57 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  37.26 
 
 		 316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  41.03 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  33.97 
 
 		 737 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 317 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.37 
 
 		 346 aa  133  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.74 
 
 		 380 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  37.56 
 
 		 344 aa  133  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  32.09 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  30.59 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36.59 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  32.31 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>