More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1916 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1916  twitching motility protein  100 
 
 		 393 aa  794    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.368763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1132  twitching motility protein  65.98 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1694  twitching motility protein  53.98 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3052  twitching motility protein  52.47 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  43.01 
 
 		 391 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  43.09 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  43.93 
 
 		 383 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  46.97 
 
 		 427 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  46.97 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  46.11 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  41.95 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  46.18 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  43.48 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  44.48 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  42.94 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  41.04 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.95 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  42.09 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  42.23 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  42.57 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.74 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  42.17 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  41.81 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  40.56 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  40.28 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  41.09 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.14 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  41.29 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  41.35 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  42.17 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  41.01 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  42.98 
 
 		 383 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  41.01 
 
 		 378 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  41.4 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  41.62 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  42.86 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  42.86 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  41.46 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.6 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  42.11 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  42.7 
 
 		 348 aa  262  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  41.45 
 
 		 347 aa  262  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.07 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  40.4 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  43.8 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  42.52 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  41.69 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  41.25 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  41.69 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  41.29 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  39.3 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  42.6 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  42.65 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  42.6 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  40.23 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  42.17 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  42.99 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  43.6 
 
 		 344 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  42.05 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  39.6 
 
 		 374 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  40.74 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.6 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  38.96 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  39.5 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  41.09 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  42.15 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  40 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  42.31 
 
 		 347 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  41.12 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  42.31 
 
 		 347 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  39.89 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  41.84 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  40.4 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  40.22 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  44.48 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  39.05 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  40.17 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  40.06 
 
 		 350 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  38.66 
 
 		 368 aa  252  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  40.12 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  38.36 
 
 		 370 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  40.46 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  40.35 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  40.99 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.65 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  41.23 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  39.77 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  39.89 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  40.82 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  38.74 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  41.74 
 
 		 344 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  39.83 
 
 		 365 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  40.17 
 
 		 366 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.74 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  38.42 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  38.78 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  40.35 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  37.53 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  40.95 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  41.64 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>