159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2293 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2293  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 384 aa  744    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3096  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.16 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0496806  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 		 810 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 878 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 927 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.38 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 4079 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.39 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29 
 
 		 875 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.82 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3035 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1276 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.17 
 
 		 1694 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 		 1022 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 542 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1421 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 543 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20 
 
 		 738 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.94 
 
 		 706 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 265 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 708 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.29 
 
 		 730 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  28.07 
 
 		 538 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 648 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 649 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1961  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0585207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1138 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 762 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 586 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  20.72 
 
 		 617 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.9 
 
 		 1979 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 602 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 732 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.45 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.16 
 
 		 638 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 714 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 615 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  22.41 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 711 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.82 
 
 		 503 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 792 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.05 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.19 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 789 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 598 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.74 
 
 		 3145 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 615 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 371 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 		 818 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 2262 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.98 
 
 		 219 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 750 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 4489 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 547 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 280 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 619 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 589 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 1737 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>