More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1149 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  100 
 
 		 495 aa  1016    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  33.18 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  31.15 
 
 		 502 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  29.8 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  30.6 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  29.35 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  29.35 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  31.29 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  33.08 
 
 		 505 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  33 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  33 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  29.32 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  31.97 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  32.49 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  29.78 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 520 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  31.28 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  31.81 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  30.92 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  29.28 
 
 		 521 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  29.28 
 
 		 521 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  30.92 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  30.92 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  30.92 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  30.92 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  30.92 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  30.2 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  31.77 
 
 		 522 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  29.36 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  28.51 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  29.01 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  29.49 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  30.07 
 
 		 486 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  29.7 
 
 		 527 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  31.14 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  31.68 
 
 		 510 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  30.35 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  29.04 
 
 		 510 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  31.11 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  49.7 
 
 		 417 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  47.83 
 
 		 611 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  28.03 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  29.57 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 308 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 308 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.71 
 
 		 669 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  49.39 
 
 		 417 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 504 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  28.4 
 
 		 485 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.49 
 
 		 917 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  28.13 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  29.81 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  30.87 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  29.95 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  30.42 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2313  sensory box/GGDEF domain protein  47.06 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  47.02 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  32.82 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  27.96 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  43.27 
 
 		 565 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  42.05 
 
 		 334 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  43.6 
 
 		 320 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.88 
 
 		 792 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  47.47 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  45.81 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  29.7 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  42.27 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>