More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0110 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  72.14 
 
 		 140 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  71.43 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  68.79 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  62.14 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  67.14 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  55.71 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  54.29 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  48.57 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  39.29 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  42.55 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  33.81 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  33.81 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.3 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.53 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.22 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.11 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.17 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.65 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.39 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.16 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  31.03 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  36.9 
 
 		 627 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.73 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.29 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  31.72 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.64 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  28.87 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  32.87 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.56 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  34.93 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.89 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  35.56 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.99 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.34 
 
 		 310 aa  57  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.71 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.76 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.76 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  35.71 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  33.33 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  27.66 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  28.97 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.63 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  25.36 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.95 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  37.5 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30.71 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  29.61 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  38.64 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  30 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.36 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  29.86 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.65 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.26 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.23 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.56 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.59 
 
 		 297 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.48 
 
 		 304 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  48.08 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  36.62 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  34.01 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.27 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>