More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2979 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  67.26 
 
 
1061 aa  1383    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  67.1 
 
 
1070 aa  1397    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  69.59 
 
 
1087 aa  1494    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  63.3 
 
 
1084 aa  1222    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  69.51 
 
 
1069 aa  1456    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1079 aa  2120    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  67.26 
 
 
1061 aa  1383    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  36.37 
 
 
1057 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 
1011 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 
1050 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 
1082 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 
1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 
1044 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 
1024 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 
1024 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 
1173 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.27 
 
 
1081 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 
1043 aa  445  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1086 aa  446  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1102 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 
1023 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 
1083 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 
1087 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 
1087 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 
1085 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1087 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 
1044 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1026 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 
1087 aa  432  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1085 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 
1043 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 
1083 aa  426  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1034 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 
1091 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 
1095 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1024 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 
1046 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 
1028 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1053 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 
1040 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.29 
 
 
1068 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 
1051 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.74 
 
 
1024 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 
1470 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 
1048 aa  383  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1029 aa  383  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 
1038 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 
1039 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  27.88 
 
 
1038 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1038 aa  380  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.96 
 
 
1049 aa  376  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 
1032 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 
1050 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 
1041 aa  376  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 
1058 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 
1048 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1017 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 
1071 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 
1037 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 
1058 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1042 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  28.55 
 
 
1103 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 
1496 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 
1041 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 
1044 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 
1006 aa  370  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 
1060 aa  367  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1037 aa  366  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 
1055 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 
1039 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1031 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 
1014 aa  365  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.55 
 
 
1041 aa  365  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 
1040 aa  365  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 
1033 aa  364  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 
1033 aa  364  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28 
 
 
1069 aa  364  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 
1048 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 
1041 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1039 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 
1034 aa  362  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 
1042 aa  360  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 
1048 aa  360  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.49 
 
 
1036 aa  360  9e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 
1031 aa  360  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.94 
 
 
1024 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 
1030 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 
1031 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.6 
 
 
1040 aa  357  7.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 
1042 aa  357  7.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4107  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  28.82 
 
 
1067 aa  356  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666055  normal  0.120279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 
1040 aa  356  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 
1037 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 
1054 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  27.5 
 
 
1405 aa  356  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 
1054 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1027 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>