232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5207 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  100 
 
 
598 aa  1212    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  39.72 
 
 
656 aa  345  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  29.97 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  26.76 
 
 
556 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  27.82 
 
 
575 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  31.28 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  31.28 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  31.28 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.43 
 
 
510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  28.62 
 
 
548 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3586  Resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
401 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  26.11 
 
 
465 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.91 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
517 aa  114  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 
548 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 
540 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.46 
 
 
542 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.36 
 
 
554 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.64 
 
 
537 aa  97.8  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  31.46 
 
 
488 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.14 
 
 
578 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 
565 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.9 
 
 
601 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  30.38 
 
 
409 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.54 
 
 
494 aa  87.8  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  23.82 
 
 
551 aa  87.4  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  22.92 
 
 
662 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.27 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.16 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.68 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.49 
 
 
515 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.47 
 
 
537 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  26.53 
 
 
564 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.8 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  26.41 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.26 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  20.55 
 
 
482 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  23.01 
 
 
496 aa  82  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5182  hypothetical protein  55.81 
 
 
82 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  29.3 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.05 
 
 
547 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.34 
 
 
532 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  25.96 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  23.43 
 
 
552 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.03 
 
 
569 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.32 
 
 
561 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.15 
 
 
484 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  21.9 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 
551 aa  76.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.9 
 
 
484 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.06 
 
 
563 aa  75.5  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  22.97 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.59 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  30.2 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 
555 aa  74.3  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  20.59 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  30.2 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.28 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.18 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  27.92 
 
 
331 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.98 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.87 
 
 
252 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  22.3 
 
 
697 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  21.89 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.13 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.91 
 
 
509 aa  70.5  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.48 
 
 
505 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.99 
 
 
534 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.4 
 
 
558 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.28 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.33 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  22.52 
 
 
562 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.81 
 
 
519 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  24.5 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.47 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.74 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.48 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  21.36 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  22.02 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.5 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.5 
 
 
534 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.9 
 
 
552 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.5 
 
 
534 aa  67  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.43 
 
 
500 aa  66.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  25.66 
 
 
520 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  20.75 
 
 
520 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  21.53 
 
 
516 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.19 
 
 
606 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.19 
 
 
606 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.24 
 
 
565 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 
546 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  26.34 
 
 
518 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>