88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2807 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 343 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  32.52 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  30.99 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.36 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  30.72 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.82 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.61 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  27.3 
 
 		 588 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.66 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  28.77 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  22.35 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 493 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25.82 
 
 		 601 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.95 
 
 		 863 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.52 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.61 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.43 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  29.53 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  30.11 
 
 		 853 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  26.22 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  23.98 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.66 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  27.7 
 
 		 590 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.49 
 
 		 1115 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.47 
 
 		 869 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 468 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  26.41 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26.27 
 
 		 566 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  26.2 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  27.69 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  26.11 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  29.93 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  42.47 
 
 		 831 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.87 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  39.74 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  23.68 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  27.09 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 847 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  26.53 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  27.41 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  35.62 
 
 		 725 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.87 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  32.88 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  37.5 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  25.27 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  21.47 
 
 		 436 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  27.27 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  26.92 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  25.58 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  24 
 
 		 516 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  35.14 
 
 		 827 aa  52.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  25 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 814 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  23.84 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  20.68 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  20.12 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  19.54 
 
 		 556 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.53 
 
 		 673 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  25.31 
 
 		 635 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  21.81 
 
 		 632 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  24.86 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  21.03 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  25.08 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  32.43 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  24.29 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  24.69 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  24.12 
 
 		 1221 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  35.62 
 
 		 620 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  25.39 
 
 		 425 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  24.11 
 
 		 475 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>