More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5138 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 789 aa  1605    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  43.72 
 
 		 785 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  46 
 
 		 810 aa  621  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  44.69 
 
 		 786 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 907 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  43.47 
 
 		 782 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 809 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  42.31 
 
 		 810 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 		 795 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 		 852 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  40.91 
 
 		 806 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 		 769 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 816 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 767 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  38.35 
 
 		 808 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 812 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 824 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 805 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 864 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 793 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 789 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 711 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 859 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 850 aa  204  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 696 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.52 
 
 		 696 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 817 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 860 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.39 
 
 		 708 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 837 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 708 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 741 aa  191  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.26 
 
 		 709 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 791 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.23 
 
 		 703 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 843 aa  187  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 795 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 815 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 708 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 807 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 809 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 796 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 767 aa  181  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 689 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 806 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 734 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.01 
 
 		 711 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 786 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 825 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 701 aa  173  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.47 
 
 		 792 aa  173  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 825 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 794 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 738 aa  170  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 703 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.75 
 
 		 801 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 715 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 766 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 771 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 819 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 742 aa  164  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 769 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.26 
 
 		 703 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  25.81 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 722 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 771 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 706 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 723 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 706 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.36 
 
 		 808 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 724 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 713 aa  155  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.12 
 
 		 806 aa  155  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 797 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 710 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 821 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  25.69 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 745 aa  150  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 750 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 743 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.03 
 
 		 797 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 696 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.57 
 
 		 695 aa  147  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 707 aa  147  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 710 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 709 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.36 
 
 		 696 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>