254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2186 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 536 aa  1078    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  67.26 
 
 		 1115 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  52.63 
 
 		 578 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  51.54 
 
 		 884 aa  219  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  49.55 
 
 		 957 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  70 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  41.7 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  37.17 
 
 		 801 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  57.94 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.09 
 
 		 1132 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.85 
 
 		 610 aa  153  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 		 340 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  44.44 
 
 		 673 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  53.72 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  54.46 
 
 		 569 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 		 705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  45.77 
 
 		 1167 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  55.36 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  30.62 
 
 		 827 aa  110  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  47.58 
 
 		 639 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.09 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 375 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  44.53 
 
 		 877 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  41.54 
 
 		 1391 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.25 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  42.5 
 
 		 863 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  39.84 
 
 		 869 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  43.44 
 
 		 982 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.95 
 
 		 634 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 		 1782 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  40.15 
 
 		 853 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  42.4 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  27.82 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  37.59 
 
 		 501 aa  90.1  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  28.93 
 
 		 1271 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  47.79 
 
 		 918 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  39.85 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  28.78 
 
 		 1132 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  38.14 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.34 
 
 		 933 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  36.46 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1024 aa  83.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.26 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  26.22 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  41.59 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.5 
 
 		 1290 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.37 
 
 		 1362 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.09 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.26 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  34.95 
 
 		 951 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  25.36 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.97 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 		 1443 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  37.69 
 
 		 912 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 370 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  39.17 
 
 		 948 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.76 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  37.8 
 
 		 1444 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11233  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07160)  26.95 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.91 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  24.93 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  33.99 
 
 		 1015 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  38.28 
 
 		 965 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.72 
 
 		 674 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 1598 aa  76.6  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.42 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  24.71 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  28.29 
 
 		 772 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  36.09 
 
 		 928 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.1 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 904 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.1 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  24.5 
 
 		 760 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  24.23 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00840  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  26.82 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 1246 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  28.42 
 
 		 521 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  32.84 
 
 		 1164 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 618 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  22.49 
 
 		 366 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  35.77 
 
 		 1091 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.52 
 
 		 792 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>