92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00840 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00840  conserved hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  973    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
370 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11233  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07160)  27.65 
 
 
677 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.658475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.16 
 
 
536 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  39.58 
 
 
827 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.49 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.19 
 
 
463 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  21.46 
 
 
1132 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.95 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.86 
 
 
396 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.87 
 
 
1362 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
1115 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
1246 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  29.34 
 
 
1271 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 
355 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  27.53 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07613  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 
823 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481464  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.77 
 
 
868 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32 
 
 
869 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.97 
 
 
868 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.9 
 
 
542 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  23.99 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  30.97 
 
 
867 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
868 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.96 
 
 
1080 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
868 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  29.03 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.7 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.77 
 
 
868 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.46 
 
 
563 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.63 
 
 
373 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  30.46 
 
 
536 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  21.45 
 
 
674 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.7 
 
 
703 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  26.3 
 
 
414 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
375 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
863 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  21.32 
 
 
674 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
578 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  21.2 
 
 
372 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  22.5 
 
 
674 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  22.96 
 
 
1598 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  22.5 
 
 
674 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 
1443 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 
674 aa  53.5  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.03 
 
 
868 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  21.32 
 
 
674 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  21.09 
 
 
674 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  21.32 
 
 
674 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  21.09 
 
 
674 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  21.32 
 
 
674 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  21.09 
 
 
674 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.14 
 
 
377 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
1776 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  23.75 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.4 
 
 
639 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  28.48 
 
 
855 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
340 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.81 
 
 
848 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  23.94 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  25.65 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  25.65 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  25.65 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  25.35 
 
 
699 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  25.65 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
1782 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.88 
 
 
657 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  23.81 
 
 
521 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  24.32 
 
 
539 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  23.76 
 
 
848 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  27.54 
 
 
792 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 
583 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  26.29 
 
 
651 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  23.91 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  29.17 
 
 
662 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  23.49 
 
 
801 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
652 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1273  glycosy hydrolase family protein  26.21 
 
 
289 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1225  chitinase  26.21 
 
 
434 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.286383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  29.21 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 
586 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10838  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
1233 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  22.79 
 
 
861 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  26.29 
 
 
1481 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.658967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.77 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>