268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0502 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  36.43 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  32.86 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  31.49 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  27.76 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  27.3 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.28 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  28.37 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  24.73 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  28.37 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  28.19 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  25.09 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  22.14 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.38 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  28.77 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  24.83 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  24.49 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.72 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  23.75 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.56 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.34 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  25.65 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  30.61 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.36 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.13 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.97 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  27.71 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  34.21 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.67 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.25 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.38 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  23.58 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.19 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  25.09 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.08 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  23.93 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.61 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  26.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  27.47 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  27.85 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.41 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.61 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  24.26 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.19 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  29.56 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.52 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.32 
 
 		 415 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.93 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.8 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.7 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  31.29 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  31.72 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.67 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.77 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.38 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  27.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.26 
 
 		 148 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  30.56 
 
 		 135 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.67 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  22.67 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  24.45 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.77 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  25.11 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.33 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.76 
 
 		 140 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.76 
 
 		 146 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.6 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  26.85 
 
 		 153 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  28.48 
 
 		 164 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  26.85 
 
 		 153 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>